ブログサービス側でも引き続き閲覧や編集が可能です。
Annexのブログ設定を行うことで、ブログ側に何らかの影響を及ぼすということはありません。

Annexのブログ機能は、サイト内にブログ側で作成した記事のみを読み込み、表示させるという設定となります。
ページ内に、ブログの記事や文章のみを読み込み、貼り付けるといったイメージになります。