既存のフォームの内容を変更した場合、変更後も同じCSVファイル内に引き続き蓄積されます。変更前までに送信されたフォームのデータが同じCSVファイル内から削除されるといったことはありません。
別のCSVファイルとして管理したい場合は、既存のフォームの変更ではなく、コンテンツを追加 > フォーム > フォーム より新しいフォームを設置してください。